Par où commencer... Y'a trop de choses à dire sur lui !!
Shadow est un hérisson créé artificiellement par le professeur Gerald, le grand père du Docteur Robotnik. Il est l'ultime forme de vie (Ultimate Life Form) et a été créé pour protéger les humains. Mais il se détournera de ce but et n'aura de cesse que les humains soient punis de ce qu'ils lui ont fait subir.
En effet, la petite fille du Professeur Gerald, Maria, était sa meilleure amie et seule amie. Mais elle était atteinte d'une grave maladie qui l'empêchait de vivre sur Terre, c'est pourquoi son grand-père avait installé un laboratoire dans une colonie spatiale, la colonie ARK. Maria vivait donc dans l'espace, rêvant d'aller sur Terre pour rencontrer les humains et se faire beaucoup d'amis. Shadow fut donc créé sur l'ARK, et Gerald injecta au hérisson noir le sang de Maria dans les veines, ce qui le lia fortement à la jeune fille. Gerald avait en réalité exécuté ses recherches pour trouver un moyen de guérir sa petite fille, en découvrant le secret de l'immortalité. Shadow est son ultime projet, et est immortel dans le sens où le temps n'a pas prise sur lui. Dès lors, Maria et Shadow devinrent tels des frères et soeurs.
Mais l'armée prit peur en découvrant le projet Shadow et envoya une escouade arrêter les scientifiques de l'ARK et détruire la forme de vie suprême. Maria parvint à enfermer Shadow dans une capsule spatiale pour l'éjecter sur la Terre et le sauver, puis elle fut tuée d'une balle. Elle hante le souvenir de Shadow qui s'est promis de se venger des humains. En fait, son désir de vengeance est celui de Gerald, qui, avant d'être fusillé par l'armée, eut le temps de modifier le cerveau de Shadow pour lui injecter une haine profonde envers les humains.
Shadow ne se rappelle pas de son passé, il sait seulement qu'il est la forme de vie suprême et qu'il doit venger Maria. Souvent, des flash-back lui reviennent, du temps où il vivait avec la jeune fille ou bien le moment où elle est morte devant ses yeux.
Toujours sérieux et énigmatique, auparavant désireux de détruire l'humanité toute entière et en particulier Sonic, Shadow rejoindra par la suite le côté hero. Sa vitesse égale celle du hérisson bleu et il maîtrise le "Chaos Control", une technique de téléportation grâce aux émeraudes du Chaos.
Dans Shadow the hedgehog, on apprend qu'il est étroitement lié à des aliens, les Black Arms, et qu'il aurait été crée avec le sang de leur chef, Black Doom. En échange de son sang, Gerald aurait promis à Black Doom que Shadow lui rapporterait les sept émeraudes du Chaos.
Bref, l'histoire de Shadow est bien difficile à cerner et se révèle au fur et à mesure.